一句话总结区别：港股通是「用内地A股账户、人民币结算、只能买约500只指定港股」的合规便捷通道；直接开香港券商账户是「用香港券商、港币/美元结算、能买全市场所有港股（含打新、衍生品）」的完整通道。两条路分属两套监管体系，怎么选取决于你的资金规模、投资范围和要不要换汇。先说港股通。它是沪港通（2014年）、深港通（2016年）开通的互联互通机制，内地投资者直接在自己现有的A股账户上开通权限就能用，不需要去香港、不需要香港银行卡，人民币结算、系统后台自动换汇，入金方式和A股一样走银证转账，秒级到账。
但有三条硬限制：一是门槛，申请开通前20个交易日证券及资金账户日均资产不低于人民币50万元；二是标的限制，只能买卖港股通名单内的股票（约500多只，覆盖恒生大型/中型指数成分股和AH股，如腾讯、阿里、美团），不能买小盘股、不能参与港股IPO打新（个人）、不能交易衍生品；三是交易和税收细节，港股通交易T+0但资金T+2交收、卖出资金T+3才可取，持有港股分红要扣20%红利税。
再说直接开香港券商账户。需要找持牌香港券商（富途、长桥、老虎、盈透等），或香港银行证券户口，账户资金存在香港。