这两张证书总是成对出现，让无数新手看到就头大，但它们的区别其实一句话就能讲清楚：公司注册证书（CI）是公司的"出生证明"，证明这家公司在法律上成立、拥有独立的法人资格；商业登记证（BR）是公司的"营业执照"，证明这家公司有合法经营的资格、要开始缴税了。一个管"存在"，一个管"营业"。
再拆细一点，两者有四条关键差异。第一，颁发机构不同：CI由香港公司注册处（Companies Registry）签发；BR由香港税务局辖下的商业登记署签发。这也是为什么说它们是两套制度——公司法是公司注册处的领域，税务是税务局的领域，一分管一。
第二，法律意义不同：有了CI，公司才有独立的"法人资格"——它是法律上的"人"，可以自己的名义签合同、持有资产、独立承担债务；而BR只确认你进行了商业登记、成为纳税人主体。第三，适用范围不同：CI只有有限公司才有（无限公司/独资/合伙都不需要，它们没有法人资格，直接办BR就够了）；BR则几乎人人都要——任何在香港经营业务的主体，包括有限公司、无限公司、独资、合伙，法律规定都在开业后一个月内申请商业登记。