先说最重要的结论：专利保护是「地域性」的——在香港申请的专利只保护香港境内，在内地申请的只保护内地，两者不会自动互通。所以如果你的发明两边都要用，就必须在两处分别申请。理解了这一点，再看香港和内地的专利制度差异，主要集中在三处：专利类型、审查方式、以及获取途径。
第一处不同：专利「类型」不一样。内地有发明专利、实用新型专利、外观设计专利三种；香港只有标准专利和短期专利两种，外观设计单独设一套制度。大致对应关系是：香港的「标准专利」类似内地的发明专利（最长保护期都是20年、都要经实质审查），香港的「短期专利」类似内地的实用新型（保护期较短——香港最长8年、内地10年，都无需实质审查，走形式审查即授权）。所以内地企业家会习惯「发明＋实用新型」双申报的，到了香港要换个思路：对应的是「标准专利＋短期专利」。
第二处不同：审查方式。内地的发明专利必须经国家知识产权局实质审查（新颖性、创造性、工业应用）才会授权；香港的短期专利只需形式审查就可快速批予（这也是它「短」的原因），但要确定它到底稳不稳，可以事后请求处长进行批予后的实质审查——换句话说，香港短期专利是「先授权、可后查」，内地实用新型是「先登记、无效另说」，概念相通但程序不同。
第三处不同（也是香港最有特色的一点）：标准专利有「两条路」。